O programa Vouchers para Startups, lançado em novembro de 2022 com 90 milhões de euros do Plano de Recuperação e Resiliência (PRR), está sob investigação por possível fraude. A Startup Portugal identificou vários casos suspeitos onde os candidatos podem ter tentado obter fraudulentamente fundos públicos e reportou estes ao IAPMEI.
As autoridades estão agora a rever estes casos, com procedimentos legais em curso. Embora o número de suspeitos e os montantes envolvidos permaneçam não divulgados, o programa apenas aprovou 21% das 5,000 candidaturas recebidas até fevereiro, atribuindo 31.5 milhões de euros em incentivos. Muitas candidaturas foram rejeitadas por falta do "componente verde" exigido—um foco na eficiência energética ou na redução da poluição.
O governo propôs reduzir o programa, diminuindo os seus objetivos de apoiar 8,600 empresas para 5,600 devido ao progresso lento e queixas de candidatos. Esta mudança deverá cortar o impacto financeiro do programa em 50 milhões de euros.